生信+Meta分析

 

背景:MiR-375作为miRNA家族的一员,在前列腺癌中发挥着重要作用。我们的目的是利用数据库分析探讨miR-375在前列腺癌中的表达和可能的分子机制。
方法: 首先,对GEO数据库中20个符合条件的数据集进行t检验、亚组分析以探索miR-375在前列腺癌中的表达。然后将meta分析的结果在TCGA数据库中进行t检验和配对t检验。miR-375的候选基因是通过四个平台预测的。通过构建PPI网络、GO和KEGG富集分析来研究miR-375在前列腺癌中的潜在分子机制。


 

 

 

 

对20个数据集中疾病组组和正常组之间的miR-375表达进行meta分析。SMD=0.71(95%CI:0.38-1.04)。

 

 

纳入meta分析的综合SMD漏斗图


疾病组和正常组之间miR-375表达的亚组分析

 

MiR-375在邻近的正常组织和前列腺癌组织中的表达

 

部分富集分析的柱状图

 

 

目标基因的PPI网络图

 

 

线上教学

Online Teaching